Molecular characterization and comparisons of potato wart (Synchytrium endobioticum) in historic collections to recent findings in Canada and the Netherlands ... : التوصيف الجزيئي ومقارنات ثؤلول البطاطس (Synchytrium endobioticum) في المجموعات التاريخية بالنتائج الحديثة في كندا وهولندا ...

Abstract Synchytrium endobioticum (Schilb.) Perc. is a chytrid fungus causing potato wart disease and is one of the most important quarantine diseases on cultivated potato. Infected host tissues develop warts rendering the crop unmarketable. Resting spores, that can remain viable and infectious for decades, are formed in warted tissues and are released into the surrounding soil when host tissue decays. To better understand the pathogen's diversity and to potentially uncover pathways of migrations and introduction events, molecular characterization was performed on the historical S. endobioticu... Mehr ...

Verfasser: Bart van de Vossenberg
Marga van Gent
Johan Meffert
Hai D. T. Nguyen
Donna S. Smith
Thijn van Kempen
Carin M. Helderman
Karin C.H.M. Rosendahl-Peters
Naomi te Braak
Kerstin Flath
Jarosław Przetakiewicz
Willmer Pérez
Emel Çakır
Z. Sikharulidze
G. C. M. van Leeuwen
Theo A. J. van der Lee
Dokumenttyp: article-journal
Erscheinungsdatum: 2023
Verlag/Hrsg.: OpenAlex
Schlagwörter: Genomic and Epidemiological Studies of Phytophthora Pathogens / Plant Science / Agricultural and Biological Sciences / Life Sciences / Diversity and Evolution of Fungal Pathogens / Cell Biology / Biochemistry / Genetics and Molecular Biology / Genetics and Epidemiology of Plant Pathogens / Potato / Biology / Context archaeology / Genome / Phylogenetic tree / Phylogenetics / Spore / Genome browser / Botany / Genetics / FOS: Biological sciences / Gene / Genomics / Paleontology
Sprache: Englisch
Permalink: https://search.fid-benelux.de/Record/base-29165411
Datenquelle: BASE; Originalkatalog
Powered By: BASE
Link(s) : https://dx.doi.org/10.60692/wqtns-4xv46

Abstract Synchytrium endobioticum (Schilb.) Perc. is a chytrid fungus causing potato wart disease and is one of the most important quarantine diseases on cultivated potato. Infected host tissues develop warts rendering the crop unmarketable. Resting spores, that can remain viable and infectious for decades, are formed in warted tissues and are released into the surrounding soil when host tissue decays. To better understand the pathogen's diversity and to potentially uncover pathways of migrations and introduction events, molecular characterization was performed on the historical S. endobioticum resting spore collection of the Dutch National Plant Protection Organization. Mitochondrial genomes were assembled and annotated, and four novel structural variants were identified from these materials with intronic presence-absence variation in cox1 or cob genes and structural variation in the dpoB – TIR region. Several fungal isolates were shown to contain mixtures of structural variants. We analyzed the mitogenomic ... : ملخص Synchytrium endobioticum (Schilb.) بيرك. هو فطر chytrid يسبب مرض ثؤلول البطاطس وهو واحد من أهم أمراض الحجر الصحي على البطاطس المزروعة. تتطور الأنسجة المضيفة المصابة بالثآليل مما يجعل المحصول غير قابل للتسويق. تتشكل الجراثيم المريحة، التي يمكن أن تظل قابلة للحياة ومعدية لعقود، في أنسجة متآكلة ويتم إطلاقها في التربة المحيطة عندما تتحلل الأنسجة المضيفة. لفهم تنوع العامل الممرض بشكل أفضل وللكشف المحتمل عن مسارات الهجرات وأحداث الإدخال، تم إجراء التوصيف الجزيئي على مجموعة أبواغ استراحة S. endobioticum التاريخية للمنظمة الوطنية الهولندية لوقاية النباتات. تم تجميع جينومات الميتوكوندريا وتعليقها، وتم تحديد أربعة متغيرات هيكلية جديدة من هذه المواد مع تباين غياب الوجود الداخلي في جينات COX1 أو COB والتباين الهيكلي في منطقة dpoB – TIR. تبين أن العديد من العزلات الفطرية تحتوي على مخاليط من المتغيرات الهيكلية. قمنا بتحليل التسلسلات الميتوجينية التي تم الحصول عليها من النتائج الأخيرة لمرض ثؤلول البطاطس في كندا وهولندا في سياق المواد التاريخية ووجدنا أن العزلات الفطرية من التفشي الهولندي الجديد تحتوي على خليط محدد من ...