Abstract: In deze studie werd de performantie van de huidige indexen voor macro-invertebraten (de Multimetrische Macro-Invertebraat Index Vlaanderen – MMIF) en fytobenthos (Procentuele Abundantie van Impact Sensitieve en Impact Geassiocieerde Diatomeeën – PISIAD) geëvalueerd voor het Vlaamse watertype polderwaterlopen (P) met opsplitsing in zoete (Pz) en brakke (Pb) polderwaterlopen. Eveneens werd de fysicochemie van zoete en brakke polderwaterlopen met elkaar vergeleken. Op basis van chlorideconcentraties werd vastgesteld dat enkele waterlichamen die aangeduid staan als type Pb zouden moeten behoren tot het type Pz. Hiervoor werd een voorstel tot wijziging geformuleerd. De PISIAD-index bleek onvoldoende te presteren voor beide types. Voor een zinnige verandering in klasseindeling (de renspercentages van IA en IS taxa) werd namelijk geen bewijs gevonden Het werd duidelijk dat de MMIF voor de zoete(re) punten een associatie heeft met de waterkwaliteit. Voor brakke lopen vertoonde de MMIF geen zinvolle correlatie met de fysisch-chemische karakteristieken, maar eveneens werden er geen goede vervangindexen gevonden Er werd aangeraden om meer onderzoek te doen naar soortgemeenschappe in plaats van familie- en genus-gemeenschappen in brakke polderlopen. Vooral het effect van zoutfluctuatie dient hierin te worden meegenomen.