Se presenta una implementación de la metodología de lógica difusa (LD) que permite el cálculo de la calidad del agua en la Sabana de Bogotá, Colombia. Debido a que las interacciones entre los organismos acuáticos y las variables físicas y químicas son un problema matemático de gran complejidad, se requiere de técnicas robustas para la construcción de tales modelos. La LD ofrece una posibilidad debido a su habilidad para procesar simultáneamente la información “subjetiva” proveniente de expertos y la información “objetiva” recopilada mediante datos. Los resultados obtenidos con la aplicación de la LD fueron confrontados con los valores del índice fisicoquímico WQI (Water Quality Index), para comprobar el grado de confiabilidad de la metodología de LD. La prueba de chi cuadrado mostró que no existe una diferencia significativa entre los valores esperados del índice WQI y los valores observados por la estimación con el sistema de LD